במסגרת ציר הפעילות לעידוד נערות לבחור ולהתמיד בלימודי מחשבים, משיק המרכז שתי תכניות ייחודיות חדשות לנערות בגילאי התיכון. 

תכנית CyberGirlz Club היא פרי שיתוף פעולה בין המרכז לחינוך סייבר, יחידה 8200, עמותת Start Up Nation Central ועיריית מודיעין-מכבין-רעות, במטרה להכשיר נערות לשירות צבאי בתפקידים טכנולוגיים משמעותיים בחיל המודיעין. 

תכנית ממריאות היא תכנית הכשרה לנערות הציונות הדתית, שפותחה ע"י המרכז לחינוך סייבר עם מערך הסייבר הלאומי (במשרד רוה"מ), בתמיכת מנהל החינוך הדתי (חמ"ד). בסיום ההכשרה ישתבצו הבוגרות בתפקידים משמעותיים במסגרת השירות הלאומי